Resumo

Achromobacter xylosoxidans tem se destacado como patógeno importante na Fibrose Cística (FC). Entretanto, a similaridade fenotípica e genotípica entre as espécies do gênero dificulta a sua identificação podendo subestimar a sua real frequência. A identificação adequada é absolutamente necessária para compreender a epidemiologia e impacto clínico das diferentes espécies de Achromobacter. Este estudo comparou os resultados obtidos na identificação das espécies do gênero Achromobacter pelo sequenciamento do gene 16S rRNA, por Multilocus Sequence Typing (MLST) e PCR para o gene blaOXA-114-like. Foram avaliadas 28 amostras de Achromobacter spp, obtidas de 16 pacientes com FC atendidos em dois centros de referência na cidade do Rio de Janeiro, pertencentes a 17 clones previamente estabelecidos por PFGE. O sequenciamento do gene 16S rRNA, identificou as 28 amostras como A. xylosoxidans. O sequenciamento dos produtos de amplificação para o gene blaOXA-114-like revelou compatibilidade de 17 amostras com alguma variável do gene e foram caracterizadas como A. xylosoxidans. Nove amostras foram compatíveis com o gene blaOXA-258, e foram classificadas como A. ruhlandii. Duas amostras não obtiveram amplificação. A análise do MLST mostrou que 11 amostras obtiveram correspondência com quatro STs (2, 13, 35, 36) disponibilizado no Achromobacter MLST website. Em 15 amostras foram caracterizados dez novos alelos que geraram oito novos STs (198, 199, 200, 201, 202, 203, 204 e 205). Duas combinações alélicas novas foram observadas em duas amostras caracterizando dois novos STs (206 e 207). Assim, as 28 amostras corresponderam a 14 STs e quatro espécies de Achromobacter foram identificadas. Dezessete amostras foram identificadas como A. xylosoxidans, nove como A. ruhlandii, uma A. dolens e uma A. insuavis. As três técnicas foram concordantes apenas na identificação de 16 amostras de A. xylosoxidans (57,2%). A identificação de 9 amostras de A. ruhlandii foram concordantes nas técnicas de MLST e PCR para OXA-114. A. dolens e A. insolitus foram identificados somente por MLST. Concluindo, o sequenciamento do gene 16S foi uma boa ferramenta para a caracterização do gênero. A PCR do gene blaOXA-114 foi útil para a identificação das duas espécies mais frequentes na FC (A. xylosoxidans e A.ruhlandii), enquanto o MLST teve o melhor desempenho caracterizando todas as espécies descritas.