Resumo

El cultivo de arroz inundado es una de las fuentes mas importantes de producción de metano, uno de los principales gases causantes del efecto invernadero. En las condiciones anóxicas provocadas por la inundación, la materia orgánica del suelo y los exudados de la planta se fermentan a sustratos simples como acetato e hidrógeno que sirven de sustrato para las bacterias metanogénicas. La producción de metano depende de estas bacterias anaerobias estrictas que constituyen un grupo filogenéticamente coherente dentro del dominio Archaea. La particular producción de arroz en Uruguay se realiza en rotación con pasturas, no inundadas, para alimentación animal. En el ciclo mas común de seis años, el suelo experimenta dos veranos consecutivos de inundación donde se planta arroz, seguidos de cuatro años con pasturas en suelos secos aerobios. El presente trabajo describe la estructura de la comunidad bacteriana del suelo en cada año de este ciclo. Se evaluó el potencial de producción de metano de estos suelos en ensayos anóxicos en microcosmos y se comparó la estructura de la comunidad antes y después de la incubación. La diversidad de la comunidad de los dominios Bacteria y Archaea se estudió mediante los perfiles de restricción del gen 16S rRNA analizados por T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) y la diversidad de las bacterias metanógenicas se determinó con el mismo análisis aplicado al gen específico mcrA. Se cuantificaron estos genes por qPCR. La cinética de producción de metano fue similar para todas las muestras, incluido un suelo testigo no utilizado para agricultura. La comunidad de bacterias totales, arcahaeas y metanogénicas es similar en los seis suelos que alguna vez estuvieron cultivados con arroz. En cambio, difiere en abundancia y composición de la comunidad del suelo testigo de pasturas naturales. La incubación produjo un aumento significativo de las poblaciones metanogénicas en los suelos de pasturas naturales. En los seis suelos cultivados con arroz se observó que la diversidad de bacterias metanogénicas disminuía con la incubación y que los miembros de la familia Methanosarcinaceae aumentaban su proporción relativa.