Resumo

O conhecimento sobre a diversidade de microrganismos marinhos tem crescido consideravelmente devido a estudos com DNA metagenomico, extraído de amostras marinhas, porém permanece diminuto frente ao grande potencial ecológico desta área. A inacessibilidade a esta diversidade pode ser justificada pelo fato de que muitos destes microrganismos são endógenos de animais marinhos, como peixes, moluscos e anelídeos, e mantêm com eles forte interdependência. Poliquetas são anelídeos que possuem grande representatividade entre os animais bentônicos encontrados por toda costa brasileira. O trato intestinal dos poliquetas é recoberto por uma diversificada comunidade microbiana que se distingue nas diferentes sessões do intestino, o que esta relacionado com as características físicas e químicas de cada micro-habitat, podendo ser encontradas, a depender do micro-habitat estudado, comunidades compostas por bactérias tanto aeróbicas quanto anaeróbicas facultativas, oxidantes de enxofre, redutoras de sulfato e fixadoras de nitrato. O desenvolvimento de um protocolo para extração do DNA metagenomico do intestino de poliquetas é uma estratégia utilizada para direcionar e facilitar a investigação sobre a diversidade microbiana marinha em seus diferentes níveis de acessibilidade e para futuros trabalhos de bioprospecção. Este protocolo tem como base o protocolo de extração metagenomica de solo desenvolvido por Zhou em 1996. O mesmo protocolo ainda pode ser utilizado para extração de solo, apesar das modificações estabelecidas. Os resultados foram evidenciados através de eletroforese em gel de agarose e SYBR green. Para confirmação da qualidade da extração, o DNA foi purificado e quantificado. O purificado foi utilizado em PCR com primers para eubacteria, archaebacteria e desulfovobrio. A amplificação comprovou a qualidade da extração metagenomica. Etapas posteriores incluem a análise da estrutura da comunidade por DGGE, clonagem e sequenciamento.