XXI ALAM
Resumo:1256-1


Prêmio
1256-1Estudo da diversidade bacteriana do lago de Juturnaíba/RJ: levantamento e mapeamento por MALDI-TOF MS (Bruker Daltonik GmbH) e genes 16S rRNA
Autores:Isabel Nogueira Carramaschi (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Jéssica Gonçalves Vieira da Cruz (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Dalton Marcondes Silva (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Marise Dutra Asensi (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Viviane Zahner (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz)

Resumo

O presente trabalho estudou a diversidade microbiana da unidade hidrológica Lago de Juturnaíba na área rural no interior do Estado do Rio de Janeiro, localizado entre os municípios de Silva Jardim e Araruama/RJ . Foram feitas duas coletas em 2011 em quatro pontos com diferentes graus de antropofização. A água foi coletada em garrafas estéreis de 1 litro e foi processada em menos de 48 horas, mantida em refrigeração. Após centrifugação, diluição e plaqueamento em meios CLED e Ágar Nutriente foram observado crescimento de colônias que foram reisoladas para verificação de pureza e então estocadas em BHI com glicerol a -20°C. Do Ponto 2 foram isoladas 36 colônias diferentes das quais 9 foram identificadas até espécie. Do Ponto 3 das 33 colônias 3 foram identificadas. Ponto 5, 25 cepas isoladas e 4 foram identificadas. Ponto 7, 53 cepas isoladas das quais 15 foram identificadas e no ponto 8 18 isolados foram identificados em espécie. A identificação dos microrganismos foi realizada por espectrometria de massas (MALDI-TOF MS,Bruker Daltonik GmbH) e sequenciamento do gene 16S rRNA. Dentre 201 isolados no total, 59 apresentaram score acima de 2.0, o que pode ser considerado confiável ao nível de espécie pela análise por MALDITOF. As espécies identificadas foram: Aeromonas hydrophyla, A. jandaei, A. caviae, A. veronii, Pantoea stewartii, Escherichia coli, Enterobacter cloaceae, E. hormaechei, E. asbiae, E. asburiae, Providencia alcalifaciens, Serratia marcescens, S. fonticola, Elizabethkingia miricola, Citrobacter freudii, Pseudomonas flavescens, P straminiae, P. oleovorans, Staphylococcus epidermidis, Yokenella regensburgei, Bacillus megaterium, Klebisiella pneumoniae, K. variicola, Raoultella ornitholytica, R. planticola, Acinetobacter calcoaceticus, A. johnsonii, Comamonas aquática, Novosphingobium subterraneum, Shewanella putrefasciens, Dickeya zeae. Alguns isolados puderam ser identificados por Maldi-tof somente ao nível de Gênero (43 isolados). Dos isolados que tiveram o gene 16s rRNA sequenciados 20 apresentaram concordância com o Maldi-Tof. Embora o Maldi-Tof MS seja principalmente aplicado aquelas bactérias de importância médica, nossos resultados proverão informação para o upgrade do banco de dados com a introdução de bactérias isoladas do ambiente. Além disso, poderemos contribuir para o conhecimento da microbiota deste ecossistema.


Palavras-chave:  diversidade bacteriana, MALDI-TOF MS, genes 16S rRNA, lago de Juturnaíba/RJ