Resumo

O gênero Amycolatopsis (família Pseudonocardiacea) foi proposto para agrupar quatro espécies previamente classificadas no gênero Nocardia. Atualmente, contém 56 espécies, das quais metade foram descritas nos últimos cinco anos. Amycolatopsis é caracterizado pela predominância de ácido meso-diaminopimélico, arabinose e galactose no hidrolisado da parede celular (parede do tipo IV), ácido N-acetil-murâmico no peptidioglicano e padrão de lipídio polar do tipo II (presença de fosfotidiltanolamina). Nos últimos anos, tal gênero tem despertado interesse para bioprospecção de novos metabólitos bioativos, principalmente antibióticos como a rifamicina e a vancomicina. O objetivo deste estudo foi determinar a posição taxonômica de um actinomiceto isolado de solo de reflorestamento (12 anos) da cidade de Santa Bárbara do Oeste – SP, Brasil. A linhagem SB026 foi isolada em meio de cultivo SM3, a 28°C por 21 dias e preservada em glicerol (20% v/v) a -80°C. Biomassa para os estudos quimiotaxônomicos foi obtida em TSB (28°C, 72h) e glicose-extrato de levedura (28°C, sete dias). Uma suspensão salina 0,8% (10⁸ células.ml^-1) foi utilizada nos testes fenotípicos. O DNA genômico foi extraído e o gene 16S rRNA amplificado e sequenciado. A sequência foi comparada com sequências de linhagens tipo utilizando o banco de dados EzTaxon e analisada filogeneticamente usando os algoritmos evolutivos de máxima verossimilhança, máxima parcimônia e “neighbor-joining”. O isolado apresentou propriedades químicas, morfológicas e moleculares consistentes com a sua classificação no gênero Amycolatopsis. O isolado SB026 formou uma linha filética distinta na periferia do subclado do gene 16S rRNA formado por Amycolatopsis mediterranei IMSNU 20056^T. Essa posição foi sustentada por todos algorítmos evolutivos e por um valor de suporte de 82%. Além disso, a linhagem pôde ser distinguida de seus vizinhos mais próximos de acordo com as propriedades fenotípicas. Assim, estes dados indicam que o isolado deve ser reconhecido como nova espécie no gênero Amycolatopsis e o nome proposto para este novo táxon é Amycolatopsis rhabdospora sp. nov.