Resumo

El cultivo de arroz es uno de los principales rubros de exportación de Uruguay, siendo su producción sustentable cada vez más valorada a nivel mundial. La búsqueda de estrategias que permitan disminuir la aplicación de fertilizantes es uno de los puntos que se está investigando actualmente. La inoculación con bacterias fijadoras de nitrógeno que suministran nitrógeno a la planta ha sido una estrategia muy utilizada en diversos cultivos. Para utilizar inoculantes es importante conocer la comunidad de bacterias endófitas nativas (que habitan el interior de raíces y partes verdes de la planta sin causar daño a la misma), las cuales son posibles competidores del microorganismo a inocular. El ciclo de cultivo de arroz está dividido en dos etapas: una etapa seca y aerobia y otra en la que el cultivo se inunda volviéndose anaerobio el ambiente alrededor de la planta. En este trabajo se estudió la influencia de la inundación del cultivo de arroz y de la fertilización sobre la diversidad, composición y abundancia de la comunidad de bacterias fijadoras de nitrógeno endófita que habitan raíces de arroz uruguayo. Se analizaron muestras de raíces correspondientes a 3 parcelas de arroz fertilizado y a una parcela de arroz sin aplicación de fertilizante, antes y después de inundar el cultivo. Se compararon los patrones obtenidos para las distintas muestras mediante T-RFLP (Terminal Restriction Length Polymorphism) para el gen nifH, gen característico de la fijación de nitrógeno y se realizó un análisis de agrupamiento. Asimismo, se estudió la composición y abundancia de las comunidades presentes en las dos etapas del ciclo mediante clonado y PCR cuantitativa del gen nifH, respectivamente, para cada condición. De acuerdo a los resultados obtenidos las poblaciones de endófitas de las raíces se ven muy afectadas por la inundación, primando este factor sobre el factor fertilización. Las comunidades de diazótrofos endófitos establecidas en ambas condiciones son totalmente diferentes. Mientras que la comunidad presentes en las raíces de arroz antes de inundar están dominadas por bacterias del género Stenotrophomonas (46%), en el caso de las muestras tomadas luego de la inundación, la comunidad de fijadores de nitrógeno es completamente diferente y mucho más diversa, sin predominio de ningún género particular.