O presente trabalho teve como objetivo a caracterização da comunidade microbiana aplicando-se esse método, analisando-se amostras do fluido de produção (água/óleo) de um reservatório de petróleo terrestre da região nordeste do Brasil.

O DNA total obtido a partir das amostras foi amplificado por PCR tendo como alvo o fragmento de  DNAr 16S utilizando-se pares de primers específicos para os domínios Archaea (21f e 1041r) e Eubacteria (27f e 1492r). As seqüências obtidas foram analisadas no programa CodonCode Aligner e submetidas a um banco de dados utilizando o programa BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) para uma análise preliminar de identificação do microrganismo mais semelhante.

Das seqüências analisadas, foram detectados 7 gêneros (Methanothermococcus, Marinobacterium, Maritimibacter, Thioclava, Paracoccus, Methanosaeta, Parvibaculum), 4 espécies (Methanococcus maripaludis, M. thermolithotrophicus, Marinobacterium litorale, Aquaspirillum itersonii subsp. nipponicum) e 3 bactérias não cultiváveis. O gênero Methanothermococcus foi o único a estar presente em todas as amostras. A maioria dos gêneros detectados corresponde a microrganismos que podem fazer parte da microbiota de ambientes extremos (alta temperatura e/ou salinos) como é o caso do ambiente amostrado. Em uma próxima etapa do trabalho esses dados serão confrontados com (a) as análises de seqüenciamentos feitas a partir de bandas geradas pela técnica de DGGE e (b) os resultados obtidos a partir do cultivo seletivo de alguns grupos microbianos (bactérias redutoras de sulfato, redutoras de ferro, redutoras de nitrogênio, arqueas metanogênicas, totais).