25º Congresso Brasileiro de Microbiologia
ResumoID:2232-1


Área: Ecologia Microbiana ( Divisão I )

AVALIAÇÃO POR PCR-DGGE DA COMUNIDADE BACTERIANA E DE ACTINOBACTÉRIAS ASSOCIADAS AO TRATO INTESTINAL DE TRIGONIULUS CORALLINUS 

Samuel Ribeiro Passos (UFRRJ); Maria Elizabeth Fernandes Correia (EMBRAPA - CNPAB); Luís Henrique de Barros Soares (EMBRAPA - CNPAB); Jean Luiz Simões de Araújo (EMBRAPA - CNPAB); Norma Gouvêa Rumjanek (EMBRAPA - CNPAB); Gustavo Ribeiro Xavier (EMBRAPA - CNPAB)

Resumo

A matéria orgânica do solo (MOS) é definida como a quantidade de carbono adicionada ao solo por processos mediados pela fotossíntese. A fauna do solo se alimenta da MOS incorporando parte do carbono em sua estrutura e contribuindo para a ciclagem de nutrientes. Neste viés estão sendo conduzidos muitos estudos para se avaliar a capacidade que estes organismos possuem em utilizar este carbono de mais difícil incorporação e sabe-se que este processo é mediado por microrganismos. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar a diversidade bacteriana total e a diversidade de actinobacterias associadas ao trato intestinal do diplópode (Trigoniulus corallinus). A obtenção dos microrganismos se deu através da secção do terço final “hindgut” dos trato intestinal do diplópodes mantidos por 0, 15, 30, 45 e 75 dias em dieta de serrapilheira de sabiá (Mimosa caesalpineafolia) e grama (Paspalum notatun), microrganismos presentes na serrapilheira e nas fezes (coprólito) do diplópode. Cinco diplópodes foram dissecados e o hindgut foi acondicionado em solução de Ringer mais pirofosfato, agitadas em vórtex, tratadas em ultrasom por 45 s e centrifugadas a 10000rpm por 15 minutos. Procedeu-se a extração de DNA, seguida de PCR utilizando-se os iniciadores F948-CG e 1378R para bactérias totais e F243 e R1378 para actinobactéria. Segui-se a analise por DGGE, coloração do gel e geração do dendrograma de similaridade com o auxilio do software Gel Compar II. Os perfis de DGGE obtidos para bactérias totais na serrapilheira e coprólito foram pouco mais de 20% similares com as amostras oriundas do trato intestinal. No trato intestinal pode-se notar que até aos 30 dias há uma variação na comunidade bacteriana induzida pelo tipo da dieta ofertada, mas este efeito deixa de existir a partir de 45 dias, onde o tempo de incubação induziu a variação na comunidade. Para a comunidade de actinobactérias é possível notar uma diferenciação conforme o tipo de dieta oferecida. Na comunidade dos alimentados com grama, quase não houve variação da comunidade em relação ao tempo zero, enquanto nos alimentados com sabiá a variação em relação ao tempo zero foi bem evidenciada. O efeito do tempo não foi notado como nas bactérias totais. Como conclusão, a comunidade bacteriana associada ao trato intestinal do diplópode é especializada, sendo pouco similar a comunidade encontrada na serrapilheira e coprólito, a partir de 45 dias de incubação o tipo de dieta ofertada não influencia a comunidade bacteriana e a oferta de serrapilheira de sabiá alterou a comunidade de actinobactérias associadas ao trato intestinal.


Palavras-chave:  16S rDNA, Atividade hidrolítica, Diversidade microbiana, Interação microrganismo - fauna do solo, PCR-DGGE