25º Congresso Brasileiro de Microbiologia
ResumoID:1974-1


Área: Genética e Biologia Molecular ( Divisão N )

SEQUENCIAMENTO DOS GENOMAS DE LINHAGENS DE CORYNEBACTERIUM PSEUDOTUBERCULOSIS UTILIZANDO A PLATAFORMA SOLID

Rommel Ramos (UFPA); Vivian D'afonseca (UFMG); Sintia Almeida (UFMG); Sara Cuadros (UFPA); Daniela Resende (UFMG); Louise Cerdeira (UFPA); Rogério da Silva (UFPA); Anne Pinto (UFMG); Siomar Soares (UFMG); Vasco Azevedo (UFMG); Artur Silva (UFPA); Jeronimo Ruiz (IRR)

Resumo

O gênero Corynebacterium é composto por uma grande quantidade de bactérias Gram-positivas com alto conteúdo G+C. Neste gênero, um dos membros mais significativos é a Corynebacterium pseudotuberculosis: patógeno intracelular que infecta principalmente ovinos e caprinos causando a doença linfadenite caseosa. Devido a sua importância econômica e relativa baixa caracterização genética, duas diferentes linhagens de C. pseudotuberculosis biovar equi que infectam camelídeos e equídeos, respectivamente, foram escolhidas para ter seu genoma decodificado utilizando-se a abordagem de sequenciamento de nova geração conhecida como SOLID. Tendo como genoma de referencia Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 e pela utilização de diferentes abordagens computacionais de montagem de genomas a partir de fragmentos pequenos, foram obtidos os genomas das linhagens acima citadas. As coberturas obtidas a partir de leituras de 35pb foram de 200 vezes para ambas as linhagens. Após o processo de anotação estrutural, funcional e análise comparativa nossos resultados indicaram para: a) linhagem camelídeos: 2230 genes, densidade gênica de 0,98 e conteúdo GC total de 52%; e b) linhagem equídeo: 2224 genes, densidade gênica de 0,97 e conteúdo GC de 52%. Além disto, diferenças como a não ocorrência de cobertura em determinados trechos de seqüência genômica para ambas linhagens, em comparação com o genoma de referência, é um possível indicativo de ilhas genômicas. A utilização das abordagens computacionais de montagem de genomas a partir de fragmentos pequenos supracitadas, juntamente com as diferenças genômicas enumeradas poderão ser utilizadas como um recurso de suma importância para o desenvolvimento de soluções no combate a patologia causada por essas bactérias.

Apoio Financeiro: FAPESPA, FINEP, Capes, CNPq;


Palavras-chave:  Corynebacterium pseudotuberculosis, Solid, short reads