Para a determinação do estado nutricional foram utilizados métodos-padrão de antropometria e diário alimentar. Para análise microbiológica foram utilizadas 2 amostras fecais dos pacientes. Uma alíquota de cada amostra foi semeada em Agar Sangue e MacConkey em triplicata. A partir deste cultivo primário, foram isoladas 30 colônias macroscopicamente diferentes. As cepas isoladas foram submetidas a coloração diferencial de Gram. As gram positivas foram avaliadas pelas provas da Catalase, Coagulase, Bile-esculina, Optoquinina, Bacitracina e Novobiocina. As gram negativas foram avaliadas por série bioquímica contendo meio de Rugai, Citrato de Simmons e Motilidade em ágar semi-sólido a 37°C e Oxidase.

Neste estudo inicial da microbiota observou-se predomínio de Escherichia coli com as quais foram feitas análises sorológicas para diferenciação das linhagens e nenhum isolado constituiu sorotipo patogênico.

Apesar destas cepas serem possivelmente constituintes da microbiota intestinal humana, não se pode afirmar que estas, nestes pacientes, não possam atuar como patógenos oportunistas. Considerando que estes pacientes são desnutridos, com deficiência protéica e lipidica, há uma maior facilidade de translocação bacteriana e uma menor efetividade do sistema imunológico, o que pode levar a migração destas cepas para outros sítios de colonização e provocar danos como endocardites, pneumonias e mesmo sepse.