LEVANTAMENTO GENÕMICO AMPLO E DESCOBERTA DE NOVAS FAMÍLIAS DE TRANSPOSONS DE DNA DA SUPERFAMÍLIA TC1/MARINER NO GENOMA DO FUNGO PATOGÊNICO PARACOCCIDIOIDES BRASILIENSIS 

Marjorie Mendes Marini (UFMG); Patrícia Campi Santos (UFMG); Tamiris Zanforlin (UNIFESP); Roberto Rudge Morais Barros (UNIFESP); Anne Cristina Pinheiro Guera (UFMG); Rosana Puccia (UNIFESP); Maria Sueli Soares Felipe (UnB); Marcelo Brigido (UnB); Celia Maria de Almeida Soares (UFG); José Franco da Silveira (UNIFESP); Jerônimo Conceição Ruiz (CPqRR/FIOCRUZ Minas)

Variabilidade genética em fungos associa-se à presença de seqüências repetitivas e elementos genéticos móveis, ainda não investigados em Paracoccidioides brasiliensis, agente da paracoccidiodomicose. Realizou-se uma busca completa nos “assemblies” genômicos de três isolados (três espécies filogenéticas: S1, PS2 e “Pb01-like”) (http://www.broadinstitute.org), visando identificar e caracterizar elementos de classe II, transposons de DNA. Identificaram-se 1332 seqüências, classificando-se 464 (34,8%, cerca de 1% dos genomas), que representaram oito novas famílias relacionadas à superfamília Tc1/mariner (similaridade de 65-80%), denominados Trem (Transposable element mariner, A-H). Todos apresentaram pelo menos um dos domínios conservados: HTH de ligação ao DNA, CENPB e/ou domínio catalítico D,D(35)D, sendo flanqueados por repetições de 2 pb TA, características de duplicações do sitio de inserção, e repetições terminais invertidas TIRs distintas. Os elementos TremA, TremB e TremD apresentaram cópias completas e ORF integras. Por PCR, revelou-se que a distribuição de certos elementos Trem variou entre diferentes isolados associando-se de forma peculiar às espécies filogenéticas. TremC e H foram detectados em isolados de diferentes  linhagens, o que parece indicar que poderiam estar presentes num hipotético ancestral comum às três espécies filogenéticas. Análises por Southern e “chromoblot” confirmaram a presença de TremA e TremB nos isolados Pb03 (PS2) e Pb18 (S1) em várias cópias com distribuição polimórfica, ausentes de Pb01. Os elementos TremA, B e F poderiam ter sido adquiridos pelas espécies filogenéticas S1/PS2 após a sua separação da bem distinta espécie “Pb01-like”. TremD e TremE mesmo apresentando similaridade de 70%, foram específicos, respectivamente, das espécies S1 e “Pb01-like”, filogeneticamente distantes. Os dados sugerem que estes transposons poderiam ter sido adquiridos por transferência horizontal após eventos de especiação que podem ter resultado nas espécies distintas S1/PS2 (P. brasiliensis) e “Pb01-like” (P. lutzii). Observou-se por RT-PCR que TremA e B são transcritos e potencialmente ativos. Nossos resultados podem contribuir para a compreensão da arquitetura do genoma e dos processos de especiação recém descritos no gênero Paracoccidioides.