GENÔMICA COMPARATIVA ENTRE DIFERENTES LINHAGENS DE CORYNEBACTERIUM PSEUDOTUBERCULOSIS

Vívian D'afonseca (UFMG); Síntia Silva de Almeida (UFMG); Siomar de Castro Soares (UFMG); Anne Cybelle Pinto (UFMG); Rommel Thiago Jucá Ramos (UFPA); Artur Luiz da Costa da Silva (UFPA); Robert Moore (CSIRO); Anderson Miyoshi (UFMG); Jeronimo Conceição Ruiz (IRR - FIOCRUZ); Vasco Ariston de Carvalho Azevedo (UFMG)

Corynebacterium pseudotuberculosis é um patógeno intracelular Gram-positivo, agente etiológico causador da Linfadenite Caseosa (LC). Esta enfermidade acomete principalmente caprinos e ovinos sendo de grande importância econômica mundial devido as perdas anuais causadas. Este impacto tem impulsionado o estudo sobre as bases moleculares ligados a patologia desenvolvida por C. pseudotuberculosis. Com este intuito, foi sequenciado o genoma de duas linhagens de C. pseudotuberculosis (Cp1002 e CpC231), tendo como objetivo caracterizar diferenças e semelhanças na arquitetura genômica da espécie, que levam ao desenvolvimento da doença. Para tanto foi utilizado o programa Artemis, que permitiu a visualização e anotação estrutural e funcional total do genoma. Para as análises comparativas de plasticidade genômica, rearranjos, inversões, entre outros eventos, foram utilizados os programas Mauve, ACT, Artemis e BLAST. Como resultado, foram caracterizados os dois genomas das linhagens C. pseudotuberculosis 1002 e C231, os quais compartilharam diversas características em sua composição: conteúdo G+C de ambas apresentou cerca de 52%; 85% do genoma é codificante; o tamanho médio dos genes foi de 929 pb (Cp1002) e 949 pb (CpC231). Contudo, houveram diferenças entre as linhagens: CpC231 apresentou 2154 genes e dentre eles, 64 são pseudogenes. Já em Cp1002 foram preditos 2155 genes sendo que 49 são pseudogenes. CpC231 apresentou 52 genes linhagens-específicos, que por buscas de similaridade protéica utilizando o programa BLASTp, não foram encontrados em Cp1002. Utilizando a mesma abordagem para Cp1002 foram encontrados 55 genes linhagem-específicos. Tratando-se de densidade e tamanho de genoma, CpC231 apresentou o valor de 0,89 e 2.273.983 pb respectivamente, já Cp1002 foi de 0,92 e 2.320.602 pb. Tratando-se de plasticidade genômica, foi identificada uma alta similaridade a nível nucleotídico entre os genomas via ACT (BLASTn), onde foram caracterizadas duas regiões de rearranjo em CpC231. Uma região com aproximadamente 20Kb apresentou 15 genes, sendo 1 deles ligado a virulência e outra região de 30Kb com 29 genes, com 6 deles de virulência. Estes resultados poderão auxiliar no desenvolvimento de terapias mais eficazes e kits de diagnósticos específicos para a espécie, tecnologias ainda não disponíveis no combate a LC.