DIFERENCIAÇÃO LOCAL DE MEMBROS CULTIVÁVEIS E NÃO-CULTIVÁVEIS DOS FILOS ACIDOBACTÉRIA E VERRUCOMICROBIA NA RIZOSFERA DE ALLIUM PORRUM.

Ulisses Nunes da Rocha (PRI); Leo Van Overbeek (PRI); Jan Dirk Van Elsas (RUG)

A rizosfera seleciona comunidades que diferem daquelas de solos sem raiz devido à, por exemplo, disponibilidade de exudatos e novas oportunidades para colonização microbiana. Pouca informação é disponível sobre a função e distribuição de bactérias dos filos Acidobacteria e Verrucomicrobia em rizosfera; apesar desses grupos serem filogeneticamente diversos e dominantes em diferentes solos. Neste estudo, a distribuição de Acidobacteria e Verrucomicrobia foi investigada utilizando-se de técnicas dependentes e independentes de cultivo em diferentes compartimentos do solo, dividindo os solos em: sem presença de raiz (SSR), pouco influenciado pela raiz (SPR) e altamente influenciado pela raiz (SAR). 150 isolados por compartimento foram recuperados de meio sólido com baixa disponibilidade de carbono (0,275 mM de glicose) incubado por 3 semanas a 6% CO₂ e 16% O₂. A diversidade de bactérias não cultiváveis foi acessada com a construção de bibliotecas de clones utilizando-se primers específicos para bactéria (100 clones / compartimento), Acidobacteria e Verrucomicrobia (50 clones / grupo / compartimento). No SSR, 5% dos clones bacterianos foram afiliados à Acidobacteria (grupos 4 e 6) e nenhum à Verrucomicrobia; neste compartimento nenhum membro foi afiliado a esses grupos em isolados ou culturas mistas. No SPR, 9.2% dos clones bacterianos afiliaram-se à Acidobacteria (grupos 3 e 8) e um foi afiliado a Verrucomicrobia (subdivisão 2). Neste compartimento, um isolado afiliou-se à Acidobacteria (grupo 8). No SAR, nenhum clone bacteriano afiliou-se à Acidobacteria e Verrucomicrobia, apesar de ambos os grupos terem sido detectados em culturas mistas e um isolado ter se afiliado à Verrucomicrobia (subdivisão 1). Com primers para Acidobacteria, o maior número de clones afiliados ao grupo 1 foi detectado no SSR, aqueles pertencentes ao grupo 4 no SAR e aqueles pertencentes ao grupo 6 no SPR. Com primers para Verrucomicrobia, a subdivisão 2 desse grupo foi dominante no SPR e SAR e a subdivisão 3 no SSR. Supostamente, diferentes pressões seletivas presentes nesse hábitat agem nos grupos de ambos os filos resultando na diferenciação local. Este é um importante e primeiro passo para elucidar a ecologia das Acidobacteria e Verrucomicrobia na rizosfera.