| Área: Micobacteriologa ( Divisão C ) SNP NO GENE GIDB PODE ESTAR RELACIONADO COM A FAMÍLIA LAM DO SPOLIGOTYPING EM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS Fernanda Spies (UFRGS); Andrezza Ribeiro (CDCT/FEPPS); Marta Osório Ribeiro (LACEN/FEPPS); Pedro Eduardo Almeida da Silva (FURG); Maria Lucia Rossetti (ULBRA); Arnaldo Zaha (UFRGS)
Resumo Recentemente foi descrito por Okamoto e colaboradores (2007) um locus (gidB), que codifica uma 7-metilguanosina metiltransferase especifica para o 16S rRNA, como associado com a resistência em baixo nível à estreptomicina. Foi observado, anteriormente pelo nosso grupo, uma mutação no códon 16 (CTT-CGT L-R) do gene gidB muito freqüente entre os isolados e não relacionada com a resistência em M. tuberculosis.
A técnica de spoligotyping, baseada na análise do lócus de repetição direta, é um método rápido que permite a classificação dos isolados em famílias segundo a presença e ausência de regiões espaçadoras. Recentemente, outros marcadores moleculares estão sendo utilizados para a definição dessas famílias, como por exemplo os polimorfismos de único nucleotideo (SNPs).
O objetivo deste trabalho foi relacionar um SNP do gene gidB com as famílias do spoligotyping. Para isso, foi realizado o seqüenciamento do gene gidB (GeneBank AAK48404) e spoligotyping de 107 isolados de M. tuberculosis. De acordo com o spoligotyping foram encontrados 54 (50%) isolados da família LAM, e apenas um isolado não possuia a mutação no códon 16 (CTT-CGT L-R) do gene gidB (classificado pelo spoligotyping como pertencente a família LAM3 e S convergente). Foram encontrados 13 isolados da família Haarlem (12%), 2 (2%) representantes da família S, 17 (16%) da família T, dois isolados foram encontrados pertencentes a família X e nenhum deles apresentou o SNP em questão. Dez isolados (9%) são de família desconhecida (U, Unknown) e destes 6 apresentaram a mutação e de 9 (8%) isolados que não tem seus spoligotypes depositados no banco, 5 apresentaram a mutação.
A mutação no códon 16 (CTT-CGT L-R) do gene gidB parece ser LAM linhagem específica e outras técnicas de genotipagem estão sendo realizadas para essa comprovação.
Palavras-chave: gene gidB, Mycobacterium tuberculosis, SNP, spoligotyping |