| Área: Virologia ( Divisão P ) ESTUDO IN SILICO DE ESTRUTURA E FUNÇÃO DA PROTEÍNA NÃO-ESTRUTURAL 5A (NS5A) DO VÍRUS DA HEPATITE C (HCV) EM PACIENTES INFECTADOS COM O GENÓTIPO 1 E 3
Lílian Hiromi Tomonari Yamasaki (IBILCE); Helen Andrade Arcuri (UNESP); Ana Carolina Gomes Jardim (IBILCE); Cíntia Bittar (IBILCE); João Renato Rebello Pinho (FMUSP); Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello (Instituto Butantan); Paula Rahal (IBILCE)
ResumoA infecção por HCV é considerada um grande problema de saúde pública, entretanto a terapia utilizada atualmente tem sucesso em aproximadamente 50% dos pacientes com o genótipo 1. Embora os mecanismos envolvidos na resistência viral ainda não sejam esclarecidos, sugere-se que fatores virais e do hospedeiro participam deste. A NS5A está envolvida em diversos processos celulares e é um componente essencial para o HCV. Entretanto, sua estrutura e função ainda não foram bem elucidadas. A partir destes fatos, o objetivo do presente estudo foi investigar as propriedades estruturais e funcionais da NS5A in silico. Foram analisadas 345 sequências da proteína NS5A do HCV de 24 pacientes infectados com o genótipo 1 ou 3, que apresentaram diferentes respostas ao tratamento e sequências referências do Genbank. As composições de aminoácidos e de estrutura secundária demonstraram que há diferença entre os genótipos, podendo indicar que há diferenças nas interações proteína-proteína entre os genótipos, o que pode estar relacionado com a diferença da taxa de resistência ao tratamento. Além disso, foram identificados aminoácidos que variaram entre os genótipos em regiões que são investigadas como relacionadas à persistência viral. A análise funcional foi realizada com o ProtFun, que sugeriu que a NS5A estaria envolvida nas funções celulares de metabolismo intermediário central, tradução, crescimento, tranporte, ligação e hormônio. Estas funções variaram entre os domínios, suportando a hipótese de que a NS5A é uma proteína multifuncional. A análise pelo PROSITE indicou vários sítios de glicosilação, fosforilação e miristoilação, que são altamente conservados e podem ter função importante na estabilização da estrutura e função, sendo assim possíveis alvos de novos antivirais. Alguns deles estão em regiões relacionadas com a resposta ao tratamento. Outro sítio altamente conservado encontrado foi o sítio de ligação à integrina (RGD), relacionado com a localização nuclear e perinuclear de outras proteínas e pode estar ligada com formas nucleares da NS5A. Por meio da técnica de threader e modelagem molecular comparativa, foi elaborada a estrutura 3D da NS5A completa. Os próximos passos incluem a dinâmica molecular da estrutura 3D e a análise das alterações de estrutura/função de NS5A mutantes.
Apoio Financeiro: Cnpq
Palavras-chave: Bioinformática, HCV, Hepatite C, NS5A |