O ecossistema marinho antártico é composto por baixas concentrações de fontes de hidrocarbonetos de origem biogênica ou antrópica das estações de pesquisa na região. Estudos recentes demonstraram a presença de genes funcionais degradativos no ambiente marinho antártico, mas ainda não se sabe quais os microrganismos hospedeiros destes genes. Este trabalho teve como objetivo, identificar os hospedeiros bacterianos isolados do ambiente marinho pelágico da Antártica, os quais carregam genes alk, que codificam para enzima alcano monoxigenase associada à via de biodegradação de hidrocarbonetos alifáticos.
As amostras foram coletadas na Baía do Almirantado, Ilha Rei George, Península Antártica. Após o isolamento em meio Ágar Marinho (diluição 1:10), o DNA total dos isolados foi extraído e os mesmos identificados através do sequenciamento do gene rRNA 16S. As sequências referências foram obtidas do Ribosomal Database Project II. Para a amplificação e análise da presença dos genes alk nos isolados, utilizou-se um par de primers degenerados. As sequências nucleotídicas foram comparadas com sequências do banco de dados GenBank e uma árvore filogenética foi construída com o programa MEGA3.
Foram analisados 84 isolados, pertencentes aos Filos Proteobacteria (94%) e Actinobacteria (6%). As bactérias apresentaram alta similaridade com microrganismos psicrofílicos de regiões polares.
Dentre elas, 23 isolados amplificaram o gene alk, dos quais, 10 foram sequenciados: seis apresentaram similaridade ao gene alkB4 descrito previamente em Rhodococcus sp., cujos representantes são das Classes Alpha-, Beta- e Gammaproteobacteria, e da classe Actinobacteria; dois pertencem a outros grupos do gene alkB; e um foi correlacionado com uma cepa referência do gênero Delfia, que nunca foi relacionada na literatura com um grupo funcional do gene alk. Um dos isolados (Sphingomonas sp.) apresentou similaridade com uma sequência de gene alkM, que foi descrita em um dos clones ambientais de sedimentos antárticos encontrados em nosso estudo prévio, alcançando um dos objetivos deste trabalho.
Nove das sequências dos genes alk, obtidas neste estudo, foram detectadas em representantes de grupos taxonômicos diferentes das cepas referências, aonde estes genes foram descritos anteriormente, demonstrando que a circulação dos mesmos na maior parte da comunidade microbiana ainda encontra-se desconhecida quanto aos seus mecanismos funcionais e fisiológicos.
Apoio Financeiro: CNPq