Resumo

La anemia infecciosa del salmón es una enfermedad que afecta principalmente al salmón del atlántico (Salmo salar) causando enormes pérdidas económicas a la industria acuícola a nivel global. Detectada en Chile en el año 2001, es en el año 2008 que produce la mayor crisis que ha sufrido la industria salmonera chilena. El agente etiológico de esta enfermedad es el virus de la anemia infecciosa del salmón (ISAV), el cual pertenece a la familia Orthomixoviridae. Su genoma está compuesto por 8 segmentos de ssRNA de polaridad negativa, que poseen regiones no codificantes (UTR) en sus extremos y codifican para al menos 10 proteínas. Continuando con la caracterización de los virus responsables de la crisis ocurrida en Chile durante los años 2008 y 2009, en este trabajo se presenta el genoma completo de la cepa de virus ISA 901, el cual fue obtenido mediante RT-PCR de alta fidelidad. Los productos obtenidos fueron clonados y secuenciados. Tras analizar las secuencias consenso obtenidas y compararlas con la base de datos para ISAV en GenBank, se determinó que existe alta similitud con la cepa de ISAV Glesvaer/2/90 (entre un 97% y 98% de identidad). En los extremos 5´UTR y 3´UTR de cada segmento, se observa de igual forma una elevada similitud, no obstante se destaca la presencia de un gap en el extremo 5´UTR del segmento 5 y en el extremo 3´UTR del segmento 7. El posterior análisis de las regiones codificantes obtenidas para la cepa ISAV 901 adaptada a cultivo celular, con las secuencias obtenidas de la misma cepa en el primer pasaje, evidencia 5 cambios aminoacídicos en la proteína HE, 3 en Fusión y una mutación tanto en la proteína PA como en PB2. Destacándose la sustitución K321G en la proteína Fusión, posición cercana al sitio de corte que libera el péptido fusión y la sustitución D164N en HE ubicada en el dominio globular de la proteína, zona que interaccionaría con el receptor celular. Esta es la primera vez que se describe el genoma completo de un virus ISA chileno, permitiendo concluir que el virus posee extremos no codificantes altamente conservados. Y que al analizar las mutaciones sufridas por la cepa ISAV 901 adaptada al cultivo celular, en contraste a lo esperado se observan diferencias en 4 de sus 10 proteínas, sugiriendo que éstas desempeñarían un rol fundamental en la adaptación del virus a condiciones de laboratorio. Agradecimientos: Proyectos: Fondecyt N°11110212, Innova-Corfo 09MCSS-6691 y 09MCSS-6698. Beca para estudios de doctorado en Chile, Programa formación de capital humano avanzado Conicyt (D. Toro-Ascuy, JM. Saavedra).