27º Congresso Brasileiro de Microbiologia
Resumo:2244-1


Poster (Painel)
2244-1Estrutura de comunidade microbiana de uma propriedade agrícola através de análise metagenômica
Autores:Ramos, A. F. L. H. (UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora) ; Medeiros, J. D. (UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora) ; Cantão, M. E. (LNCC - Laboratório de Ciências da Computação) ; Nicolas, M. D. (LNCC - Laboratório de Ciências da Computação) ; Coelho, C. M. (UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora) ; Furtado, A.L.S. (CNPM - Embrapa Monitoramento por Satélite) ; Rodrigues, C.A.G. (CNPM - Embrapa Monitoramento por Satélite) ; César, D.E. (UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora)

Resumo

A comunidade microbiológica presente nos diversos tipos de solos exerce um importante papel na regulação dos processos envolvidos na formação e na manutenção dos ecossistemas destes ambientes. A utilização de técnicas de sequenciamento metagenômico tem levado a uma melhor definição da estrutura de comunidade microbiana discutindo o papel de espécies raras e dominantes. O objetivo do presente estudo foi comparar a estrutura da comunidade bacteriana do solo de duas áreas distintas, fragmento de floresta (FANI) e fragmento de pasto coberto por Brachiaria (FAI), de uma propriedade agrícola localizada no oeste do Estado de São Paulo. Para isso, foram coletadas aleatoriamente amostras de solo em 5 pontos diferentes para cada área, na profundidade de 0-5cm. As amostras foram homogeneizadas e o DNA metagenômico foi extraído com o PowerMax Soil Kit, MoBio. O DNA metagenômico foi sequenciado na plataforma GS FLX Roche 454. As sequências obtidas foram comparadas contra os bancos de dados NT-NCBI e NR-NCBI usando o BLAST (e-value≤1e-5). Os resultados foram visualizados com o software MEGAN v4.0. Análises realizadas no sistema automatizado MG-RAST também foram consideradas (e-value≤1e-5). Afim de determinar as diferenças estatísticas entre os dois metagenomas o software STAMP foi utilizado. Os resultados obtidos demonstraram que aproximadamente 40% dos reads não foram similares a nenhuma sequência depositada nos bancos de dados. Considerando as sequências anotadas, as 10 espécies dominantes encontradas foram as mesmas nos dois metagenomas variando apenas o número de hits para as áreas amostradas, com exceção para a Candidatus Nitrospira defluvii presente na pastagem e Bradyrhizobium japonicum presente na floresta, ambas relacionadas ao ciclo do nitrogênio. Já o número de espécies raras encontradas apenas na área impactada foi 68 e na área não impactada, 60. O maior no número (61) de espécies raras foi encontrado no filo proteobacteria principalmente na área não impactada (39). As diferenças nas classes deste filo foram principalmente em gammaproteobacteria com enterobacterias encontradas na área impactada. As análises específicas mostram diferenças na estrutura de comunidade sugerindo diferenças no papel funcional dos microrganismos específicos nesses ambientes. Apoio: MAPASTORE-CNPq 577174/2008-8