Resumo

A metagenômica permite estudar a diversidade microbiana de amostras ambientais, utilizando para análises amplicons parciais do gene 16S rRNA. A compostagem é muito utilizada na obtenção do composto orgânico rico em nutrientes e como condicionador de solos, onde restos de resíduos da agricultura podem ser utilizados como substratos para os micro-organismos durante a fermentação do composto. Para realização do estudo foi feita extração de DNA metagenômico do composto orgânico (0-20 cm) usando Fast DNA® kit for Soil (Bio 101-Quantum Biotechnologies). Após clonagem do gene parcial 16S rRNA (iniciadores Y1/Y2) em vetor CloneJET™ (123 clones), foram geradas sequencias fasta que foram analisadas com phred/Phrap/Consed. O Ribosomal Database Project (RDP II) foi usado na classificação dessas sequências. Mothur foi aplicado para determinar a curva de rarefação e índices de diversidade e riqueza Chao1, ACE, Shannon e Shimpson. Actinobacteria (53,7%) foi à população mais abundante e gêneros deste grupo são usados no biocontrole de doenças em plantas e apontados como prodores de enzimas celulases, hemicelulases, quitinases, amilases e glucanases. Firmicutes (22,8%) participam da produção e manutenção da qualidade microbiológica de queijos. Proteobacteria (21,1%), apresenta diversidade morfológica, fisiológica e metabólica, esta ultima ligada à ciclagem de nutrientes como carbono, nitrogênio, fósforo e enxofre. Apenas 2,4% dos clones não apresentaram classificação. Isto permite aferir que provavelmente Actinobacteria atua na quebra de ligações de hemicelulose e celulose e, os produtos dessa degradação, são metabolizados em conjunto com Firmicutes, estes liberando isômeros D-aminoácidos, ácidos orgânicos (reduz pH), acetaldeído e dióxido de carbono. Proteobacteria atua na disponibilização de enxofre, fósforo e nitrogênio (resíduos de aves). Mothur acusou (3%) ACE igual a 3,720, Chao1 2,461, Shannon 4,7896 e Simpson 0,0003. Foi observado 121 UTOs únicas e, juntos, esses resultados indicam que o efeito platô está longe de ser atingido. Como conclusão, foi possível compreender melhor a interação entre as populações de bactérias e os dados demonstram um amplo potencial para isolamento e emprego desses micro-organismos em estudos futuros voltados à melhoria da qualidade de alimentos, produção de implementos agrícolas, antimicrobianos e enzimas úteis à produção de etanol de segunda geração. Agradecimentos a Vale/S.A., Fapesp e Usina Santa Fé S/A.