Resumo

Introdução: A transferência horizontal de genes (THG) entre espécies é um processo envolvido na adaptação e evolução bacteriana e pode ser importante na dispersão e manutenção de funções relevantes em uma determinada comunidade bacteriana. Os principais agentes envolvidos na TGH são os elementos genéticos móveis (EGMs), como plasmídeos, transposons e fagos. Assim sendo, o estudo dos EGMs associados à comunidade microbiana de corais pode contribuir para uma melhor compreensão sobre as funções relevantes para os micro-organismos presentes neste ambiente. Materiais e Métodos: Os corais Mussismilia hispida e Madracis decactis foram coletados na Ilha de Búzios, SP. Os corais foram lavados e homogeneizados com TE. Após um breve spin, o líquido sobrenadante foi transferido para outro tubo e centrifugado a 13000 rpm por 10 min. O sobrenadante foi descartado e a extração de DNA foi feita com o kit Wizard Genomic DNA Purification (Promega). A amplificação foi realizada utilizando-se o REPLI-g Midi-kit da QIAGEN e o amplificado foi purificado com GE – GFX PCR DNA and Gel Band Purification kit, que é otimizado para fragmentos entre 50pb e 10kb. Os metagenomas foram sequenciados com a tecnologia 454. As reads foram triadas pela qualidade e as sequências barcodes, sequências mitocondriais e de vetores (possíveis contaminantes) foram retiradas. As sequências foram anotadas utilizando-se a plataforma automática MG-RAST. Os metagenomas foram comparados com outros 29 metagenomas disponíveis no banco de dados do MG-RAST. Resultados e Discussão: Foram obtidas 52,23Mb de M. hispida e 43,67Mb de M. decactis. Apenas 4,4% das reads de M. hispida e 3,4% das reads de M. decactis foram anotadas. As famílias Pfam mais encontradas em ambos os metagenomas foram PF02305 (Capsid protein (F protein)), PF00910 (RNA helicase) e PF02407 (Putative viral replication protein), confirmando o enriquecimento de sequências de fagos. A comparação com metagenomas de outros ambientes revelou que genes com funções envolvidas no estresse a dessecação, vias proteolíticas, sistema de secreção de proteínas do tipo VIII e formação de biofilme e quorum sensing, foram significativamente mais encontrados nos metagenomas de corais, enriquecidos em EGMs. Conclusão: A metodologia de coleta de material, purificação e amplificação de DNA parece ter enriquecido os metagenomas analisados com genomas pequenos, especialmente de fagos. Este estudo é o primeiro a analisar os EGMs da comunidade microbiana de corais.