Resumo

Los miembros de la familia Orthomyxoviridae, dentro de los cuales se encuentra el virus de la anemia infecciosa del salmón (ISAV), poseen un genoma que consta de ocho segmentos de RNA de simple hebra de polaridad negativa, que codifican para las distintas proteínas virales. Cada uno de estos segmentos está flanqueado por regiones no-codificantes altamente conservadas, dentro de las cuales hay secuencias que han sido descritas en otros miembros de esta familia como reguladoras de la expresión génica, y relacionadas con virulencia. A pesar de que en otros Orthomyxovirus se conoce la secuencia, estructura y función de dichas regiones no-codificantes, en ISAV sólo se ha publicado las secuencias de algunos aislados sin que se les haya atribuido aún un rol biológico. Para comprender la función de estas regiones durante el ciclo viral, se realizó una investigación comparativa utilizando las secuencias disponibles de ISAV y la información disponible del virus modelo de la familia, Influenza A. Se determinó la secuencia consenso de los extremos terminales de ISAV, la que fue analizada a 2 niveles: nucleotídico, realizando alineamientos con ClustalOmega, y estructural mediante modelamientos 2D con el programa RNAstructure y 3D con Assemble. Del análisis molecular y estructural, se identificó los posibles sitios de interacción con la polimerasa viral y la formación de dominios estructurales implicados en los procesos de transcripción y replicación del virus. Al realizar el análisis en diferentes aislados virales, se pudo proponer una relación entre eficiencia en el ciclo viral, con la virulencia de los distintos aislados de ISAV estudiados. Estos resultados permitirán sentar las bases para la propuesta de futuros modelos de estudios del virus, comprender la regulación del ciclo viral e identificar las posibles caracterísicas moleculares implicadas en la determinación de la virulencia de los distintos aislados de ISAV.